В дальнейшем Гарри часто читал мысли Волан-де-Морта, что очень помогало ему искать крестражи.

1 августа, во время свадьбы Билла и Флер, появился Патронус с известием, что Министерство магии пало. Вслед за ним стали появляться Пожиратели Смерти. Гермиона, заранее уложившая в свою сумочку рюкзаки Гарри и Рона, а также другие вещи, используя заклинание невидимого расширения, трансгрессировала вместе с ними на магловскую улочку. Они зашли в кафе, но там их поджидали Пожиратели Смерти. Гарри, Рон и Гермиона справились с врагами, но решили, что их как-то отслеживают. Они отправились в особняк Блэков на площадь Гриммо, 12 и в следующие месяцы жили там.

В первое же утро, проведённое в доме Гарри обследовал комнату Сириуса, и случайно бросил взгляд на следующую дверь, на которой значилось: «Не входить без ясно выраженного разрешения Регулуса Арктуруса Блэка». Так они догадались, что Р. А. Б. — это Регулус Арктурус Блэк и вспомнили, что видели неоткрываемый медальон в этом самом доме. Расспросив Кикимера, они узнали, что Регулус Блэк завещал Кикимеру уничтожить медальон, но Кикимер не смог этого сделать. Гарри, Рон и Гермиона объяснили эльфу, что и сами хотят того же, после чего Кикимер с ними помирился. Кикимер рассказал, что медальон украл Наземникус Флетчер. Флетчер, доставленный Кикимером, рассказал, что медальон отобрала у него Долорес Джейн Амбридж. После длительных наблюдений за министерством Гарри, Рон и Гермиона сумели проникнуть внутрь (в обличье служащих министерства), отобрать медальон, который носила Долорес Амбридж, и спасти около 20 волшебников, которых собирались отправить в Азкабан за то, что они полукровки, а то и вовсе потомки маглов. Но за ними погнался Яксли, слуга Волан-де-Морта. Уцепившись за Гермиону в последний момент, он увидел их убежище, ослабил хватку и возвратился обратно в Министерство. После этого досадного случая дом перестал быть защищённым местом. Гарри, Рон и Гермиона трансгрессировали в лес.

Следующие месяцы они жили в лесу, не зная, как уничтожить медальон или где искать остальные крестражи. Рон, на которого действовал медальон, стал капризным, сварливым и требовал называть Волан-де-Морта «Сам-Знаешь-Кем». Чтобы не обострять отношения с Роном, Гарри и Гермиона согласились. Из подслушанного разговора знакомых Дина Томаса и Теда Тонкса, а также гоблинов Кровняка и Крюкохвата, тоже скрывавшихся в лесу, Гарри и Гермиона поняли, что медальон можно уничтожить мечом Годрика Гриффиндора, а также, что меч, помещённый Снеггом в банк «Гринготтс» — поддельный. Рон, под действием медальона, устроил скандал и бросил своих друзей. Гарри и Гермиона, решили посетить Годрикову впадину. Приняв, с помощью оборотного зелия магловские обличия, они сходили на кладбище, где на могиле Певереллов увидели знак, который уже видели на медальоне Ксенофилиуса Лавгуда (впоследствии повторившйся в «Сказках Барда Бидля»). Выйдя на площадь, они увидели Батильду Бэгшот, пригласившую их к себе домой. Это была ловушка, а Батильда оказалась Нагайной, змеёй Волан-де-Морта. Гермионе удалось перенести их, но при этом она сломала палочку Гарри, но успела прихватить из дома Батильды, экземпляр «Жизнь и Обманы Альбуса Дамблдора».

Через несколько недель, во время дежурства Гарри увидел лань, бегущую в чащу. Последовав за ланью, он нашёл меч Годрика Гриффиндора на дне проруби. Гарри бросился в прорубь, достал меч, но медальон начал его душить. Вернувшийся Рон спас Гарри и разрубил медальон мечом. Рон рассказал, что жил в коттедже «Ракушка» у Билла и Флер, а дорогу обратно указал полученный от Дамблдора делюминатор.

«Сказки барда Бидля» содержали символ, идентичный тому, который был на шее Ксенофилиуса Лавгуда во время свадьбы Билла и Флер. Гарри, Рон и Гермиона отправились к нему домой, и Ксенофилиус рассказал им о Дарах Смерти. Затем они попались в ловушку: оказывается, Полумна Лавгуд арестована, и Ксенофилиус готов был выдать Гарри Поттера Пожирателям смерти в обмен на освобождение дочери. Гермиона сумела выбраться из ловушки и спасти друзей.

Трансгрессировав в очередной лесок, они услышали по радио передачу «Поттеровский дозор», которая отказывалась подчиняться контролируемому Волан-де-Мортом Министерству магии и сообщала истинные сведения о Волан-де-Морте, его сообщниках и самом Гарри Поттере. Обсуждая передачу, Гарри случайно произнес имя «Волан-де-Морт». Появились егеря, охотившиеся за потомками маглов и врагами Волан-де-Морта. Выяснилось, что отслеживаются все, кто называет Волан-де-Морта по имени: боящиеся его обыватели пользуются эвфемизмами вроде Сам-Знаешь-Кто, а его слуги называют его Тёмным Лордом. Гарри, Рона и Гермиону арестовали и привели в особняк Малфоев. При этом Беллатриса забрала Гермиону на пытку. Достав осколок зеркала, полученный от Сириуса Блэка, Гарри попросил помощи. Вскоре появился Добби (впоследствии выяснилось, что его послал Аберфорт Дамблдор, увидевший Поттера в зеркале). Благодаря помощи Добби, колебаниям Петтигрю (приведшим к смерти последнего), находчивости Гермионы, изуродовавшей лицо Поттера в момент появления Егерей, нерешительности Малфоя, очень неохотно признавшего, что мальчик перед ним — Гарри Поттер, и страху Беллатриссы, узнавшей, что у Поттера меч Годрика Гриффиндора (до этого он был там же, где и один из крестражей — в её камере хранения в банке Грингготс; она боялась, что и крестраж похищен), им удалось спастись и вызволить гоблина Крюкохвата, Полумну Лавгуд и мастера волшебных палочек Олливандера. При этом Гарри выхватил у Драко Малфоя две волшебные палочки, одна из них — палочка Драко. Эта случайная победа сделала Гарри хозяином Бузинной Палочки, хотя узнал он об этом гораздо позже. Добби был убит Беллатрисой.

Гарри, Рон, Гермиона, Крюкохват и Олливандер поселились у Билла и Флёр в «Ракушке». Вместе с гоблином Крюкохватом им удалось спланировать и совершить похищение чаши Пенелопы Пуффендуй из хранилища Беллатрисы, которая оказалась очередным крестражем. В качестве платы Крюкохват забрал меч. Из очередного видения Гарри узнал, что один из крестражей хранится в Хогвартсе.

Из видений и объяснений Олливандера Гарри узнал о судьбе Бузинной Палочки.